一般从上至下分为：质量手册、程序文件、作业指导书、记录表格，文件之间关系如下图所示：

质量手册应包括：手册的管理、编写目的、适用范围、编写依据、质量方针目标、通用要求、公正性保密性、结构要求、资源要求、人员、设施和环境条件、设备、物料、方法选择和验证、数据控制、信息管理、管理体系要求、应对风险和机遇措施、改进纠正措施、内部审核等等内容。

质量手册附件：营业执照、法定代表人授权书、法人公正性和不干预检测工作声明、岗位人员职责与任职资格表、关键岗位人员与代理人任命书、人员一览表、检测和关键设备操作授权书、公正性保密性声明、实验室平面图、检测能力表、程序文件清单等等。

程序文件的内容应与质量手册的规定一致，应包括：保证公正性程序、保护机密和所有权程序、人员管理程序、设施和环境条件管理程序、仪器设备管理程序、供应品和服务采购程序、样品管理程序、记录管理程序、结果有效性保证程序、报告管理程序、分包管理程序、委托管理程序、能力验证程序、内部审核程序、风险评估和风险控制程序等等文件。

作业指导书应为：仪器设备操作规程（环境条件、操作步骤、注意事项、仪器维护、面对意外的应急措施等）、检测方法细则（样品前处理补充/修改、方法适用范围和限制范围、方法原理和摘要、质量控制要求、结果计算、精密度和准确度、不确定度、非标检测方法等）、计量校准规程（校准周期、校准环境、校准依据等）。

记录检测活动过程中与数据相关的信息，技术层面的记录包括：现场采样记录、现场检测记录、样品保存和处置管理记录、环境条件记录、称量记录、配制记录、质控记录、仪器设备检测数据记录、标物和试剂管理记录等；质量层面的记录包括：内审过程记录、跟踪验收整改记录、计划表、发现不符合项汇总报告等。